phpMyAdminから削除できる。 mysqlのデータベースを選択して、SQLタブを押して、 call rds_rotate_slow_log このコマンドで空に出来る。 RDS(MySQL)のログファイルを削除する - Qiita RDSのスロークエリのログテーブルを空にする|茶トラ猫のエンジニア日記
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