・httpsアクセス
ELB
・IP制限
phpMyAdmin に ip によるアクセス制限をかける - Qiita
・Digest認証
htpasswdコマンドのことをそろそろ本気出して覚える - Qiita
LoadModule auth_digest_module modules/mod_auth_digest.so が必要
・blowfish_secret設定
「暗号化 (blowfish_secret) 用の非公開パスフレーズの設定を必要とするようになりました」の対処方法 - phpMyAdminの使い方
・root制限、ローカル制限
phpMyAdminのセキュリティ対策 | ホームNW研究所ホームNW研究所
phpMyAdmin-2.9.x 認証タイプ別 設定 (config.inc.php)
$cfg['Servers'][$i]['AllowDeny']['order'] = 'deny,allow';
$cfg['Servers'][$i]['AllowDeny']['rules'] = array( 'deny % from all', 'allow % from 10.1.0.0/16' );
・二段階認証の設定
phpMyAdmin のインストールとセキュリティ設定メモ | あぱーブログ